由于管道堵塞引起空调水系统不能正常工作，也是常见的弊病。在调试和试运行过程中往往发现某些房间空调使用效果很差，甚至没有效果。经查找，发现很多情况是由于施工用的麻丝、铁屑粉末等杂物堵塞管道而引起的。所以，管道系统的清洗工作直接关系到空调系统能否正常工作，应从下列几个方面加以注意。
1、首先在设计上，应考虑在管网最低处设置大口径排污阀，便于清洗时排污。如果设计上在管网顶部采用自动排气阀，施工单位在管网清洗前不要急于把排气阀安装上去，这样便于注水时满灌及排污时将管内水尽快排净。
2、在主要设备及末端装置进水管上设“Y”型过滤器，避免管网内杂物进入设备及末端装置，引起堵塞报废。对于吊顶内风机盘管的过滤器最好安装于集水盘内，便于拆洗。如集水盘不够大可要求生产厂家适当加大;如做不到这点，那么在保温时，过滤器堵盖部分应做成可拆式保温，便于以后维护中拆洗过滤器。
3、对主要设备的进、出水管间可安装短路阀，冲洗时关闭进、出水阀，打开短路阀即可对整个管网进行系统冲洗。而对于末端装置是风机盘管，由于安装空间原因安装短路阀会有困难，可在供、回水干管上考虑便于冲洗的措施。如在供水干管末端及回水干管首端设置冲洗阀，对供水和回水的水平干管分别冲洗，冲洗时注意冲洗方向应与系统运行时水流方向一致。
4、在每层水平干管上设排空阀，便于分层冲洗放空及以后日常维护。
5、对水质应定期监测，避免因冷热水污染堵塞末端装置和腐蚀管道。对于冷冻水系统，从设计上最好考虑安装电子除垢装置，并对水质每年作稳定处理，对冷却水系统也应每年进行水质处理。
